横須賀学院は、12年一貫教育を行う総合学園です。例年、小学校を卒業する児童の約9割の児童が、併設の横須賀学院中学高等学校へ推薦入学します。横須賀学院中学高等学校は中高一貫校であり、横須賀学院高等学校から入学する生徒とは異なるクラスやカリキュラムのもと、教育活動が営まれています。
 以下の表は過去5年間の、横須賀学院小学校を卒業し併設中学へ進んだ生徒の大学合格実績をまとめたものです。